发改委表示，此次专项检查，在惠农价格政策方面，要重点检查化肥等农资价格，农村用水、用电价格，医疗服务和药品价格政策的执行情况；在惠农收费政策方面，要重点检查包括农村教育收费、农民进城务工收费、农民建房收费、农用机动车收费、农产品检验检疫收费、农村通讯收费、农产品流通环节收费、农村殡葬服务收费政策的执行情况。同时，各级价格主管部门要结合惠农价格和收费检查，做好价格服务进农户工作，向农民提供政策服务、信息服务、维权服务和诚信服务，完善涉农商品和服务明码标价制度、涉农收费公示制度，建立涉农价格和收费监管的长效机制。
发改委还要求，各级价格主管部门要严格落实责任，突出工作重点，加强政策宣传，加大处理力度。要对群众反映强烈、带有普遍性的问题一查到底，多收金额要退还给农民。对检查中发现的严重损害农民利益的乱涨价、乱收费案件，不仅要进行经济制裁，还要将相关责任人员移交纪检监察部门处理。
